Universitetssykehuset Nord-Norge HF

Tromsø

Espen Mikal Robertsen

Bioinformatiker

Inger Pettersen

Seksjonsleder

<strong>2 årig engasjement med mulighet for forlengelse ved molekylærpatologisk laboratorium.</strong><p> </p><p>Er du vår nye kollega? Vi har ledig engasjement som bioinformatiker og kan by på spennende oppgaver sammen med høyt kompetente og engasjerte kolleger.</p><p>Klinisk patologi har som hovedoppgave å undersøke vevsprøver og celleprøver ved mistanke om kreft eller andre sykdommer. </p><p>Utvikling i patologifaget har bidratt til bedre diagnostisering og overlevelse av kreft. Avdelingen er del av en nasjonal satsning for å etablere infrastruktur for presisjonsdiagnostikk (InPreD) innen kreftfeltet. Dette medfører et tett samarbeid med andre universitetssykehus i Norge med mulighet for å delta i nasjonale prosjekt og jevnlige nasjonale møter. UNN skal sikre regional kompetanse, nasjonal tilgang til avansert diagnostikk for klinisk praksis og inklusjon i kliniske studier, samt optimalisering av metodologi for rutinediagnostikk.   <br />Arbeidsoppgaver for stillingen vil være knyttet opp til molekylærpatologisk laboratorium ved Klinisk patologi. Laboratoriet utfører avanserte molekylærpatologiske analyser som er avgjørende for kreftdiagnostikk og for valg av behandling (persontilpasset medisin). Analysemetodene som benyttes er hovedsakelig basert på PCR, dybdesekvensering (NGS), fluorescens in situ hybridisering (FISH) og genuttrykksanalyse. Laboratoriet har 12 ansatte og samarbeider tett med avdelingens patologer og kliniske miljøer på sykehuset. Laboratoriet har høyt fokus på kvalitetssikring og fagutvikling. I tillegg til den diagnostiske virksomheten bidrar laboratoriet aktivt inn mot kliniske forskningsprosjekter og biobankvirksomhet ved UNN. </p><p>Vi søker nå en bioinformatiker som vil få en sentral rolle i å utvikle, implementere og vedlikeholde
analysepipelines og programvare knyttet til laboratoriets diagnostiske og
forskningsrelaterte aktiviteter. Stillingen vil bidra til å sikre høy kvalitet og
effektivitet i laboratoriets arbeid, samt være en viktig ressurs i
videreutvikling av metodikk og integrasjon av nye teknologier. Hos oss får du
arbeide i et tverrfaglig miljø med høyt faglig nivå, gode muligheter for
kompetanseutvikling og deltakelse i spennende prosjekter som bidrar til bedre
kreftdiagnostikk og behandling.</p><p><br />Arbeidstid: Hverdager kl. 08.00 - 15.30 med flexitid.<br /></p><br />
<h3>Arbeidsoppgaver</h3><ul><li>Designe, implementere, refaktorere og vedlikeholde pipelines og programvare relatert til genetiske analyser</li><li>Dokumentere design av pipelines og arbeidsflyt</li><li>Delta i utarbeidelse av rapporter og prosedyrer</li><li>Delta i kontinuerlig forbedring og oppdatering av rutiner, analyser og metoder</li><li>Delta i opplæring og undervisning</li><li>Holde seg faglig oppdatert innenfor fagfeltet</li><li>Deltakelse i      forskningsprosjekt kan bli aktuelt </li></ul><h3>Kvalifikasjoner</h3><ul><li>Stillingen krever Mastergrad eller tilsvarende i bioinformatikk, Phd er ønskelig.</li><li>Solid erfaring med Linux og kommandolinjeverktøy (CLI).</li><li>Kjennskap til både tradisjonelle og skybaserte      virtuelle maskiner (VM).</li><li>Erfaring med container-teknologier som Docker og      Singularity.</li><li>Erfaring med DevOps-prinsipper og verktøy, inkludert      versjonskontroll (Git/GitHub) og CI/CD.</li><li>Kompetanse i programmering, fortrinnsvis i Python      og/eller R.</li><li>Erfaring med utvikling, vedlikehold og dokumentasjon av      pipelines og arbeidsflyter.</li><li>Erfaring med bruk av workflow-språk som Nextflow for å      lage beregningsarbeidsflyter.</li><li>Kjennskap til genomikk og bioinformatikk, inkludert      datatyper og analysemetoder.</li><li>Erfaring med analyse av NGS-data og store datamengder      er en fordel.</li><li>Evne til å bidra til automatisering av oppgaver og      analyser i diagnostikk.</li><li>Gode formidlingsevner i engelsk.</li><li>Gode norsk muntlig og skriftlig egenskaper er en fordel.  </li></ul><h3>Personlige egenskaper</h3><ul><li>Evne til selvstendig      arbeid, være innovativ og løsningsorientert.</li><li>Gode kommunikasjonsevner og evne til å jobbe i team.</li><li>Evne til å arbeide strukturert      og målrettet.</li><li>Evne og vilje til      å holde seg faglig oppdatert.</li><li>Personlig egnethet og      motivasjon for stillingen vil bli vektlagt. </li></ul><h3>Vi tilbyr</h3><ul><li>Et godt, stimulerende og dynamisk miljø i stor utvikling.</li><li>Interessante faglige utfordringer og gode muligheter for egenutvikling.</li><li>En sentral rolle i etableringen og videreutviklingen av bioinformatisk aktivitet ved avdelingen, samt bli en del av et tverrfaglig bioinformatikkteam bestående av bioinformatikere fra andre avdelinger ved sykehuset.</li><li>Lønn i henhold til gjeldende overenskomster.</li><li>En arbeidsplass som er IA-virksomhet (Inkluderende Arbeidsliv i samarbeid med NAV).</li></ul><h3>Kontaktinformasjon</h3>Inger Pettersen, Seksjonsleder, &#43;4741507362<br />
Espen Mikal Robertsen, Bioinformatiker, &#43;4792083113<br />
<h3>Arbeidssted</h3>Hansine Hansens veg 67<br />
9019 Tromsø<br />
<h3>Nøkkelinformasjon:</h3>Arbeidsgiver: Universitetssykehuset Nord-Norge HF<br />
<br />
Referansenr.: 4991698504<br />
Stillingsprosent: 100%<br />
Engasjement<br />
Søknadsfrist: 24.08.2025<br />
<br />


Bioinformatiker- Klinisk patologi, Seksjon for Spesialanalyser